主要是通过药物作用在息肉上，令息肉坏死、干枯继而脱落，或是通过口服缓解病症，通常是比较适合初期、单纯的息肉。

目前对息肉手术治疗方法有药物注射疗法、红外线治疗、激光治疗、切除治疗以及微创术治疗等多种，不同的治疗方法，其治疗效果是不同的。

可从肛门内取出的息肉，用肛门镜或扩肛器扩开肛门，钳子夹住息肉，在基蒂部用丝线结扎，切除息肉。广基的息肉切除后，粘膜的创面要予以缝合。

息肉位置高，无法用上述方法治疗，需要在硬膜外麻醉下开腹切开直肠前壁切除息肉。已恶变的要按直肠恶变治疗。

其他炎性息肉可采用抗生素、激素保留灌肠治疗。

是通过利用吻合器对息肉进行切除，在切除的同时瞬间吻合伤口，具有痛苦小、安全系数高、术后恢复快、费用低等优点，避免了传统手术恢复时间长、费用高的缺点，且可以同时在多处行息肉切除术。